Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC6Q16204 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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