Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP13Q15645 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP13Q15645 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIP13Q15645 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIP13Q15645 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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