Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKD1Q15139 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKD1Q15139 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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