Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CUL3Q13618 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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