Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.18□□□□□ -1.421e-323■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.966e-8■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.876e-8■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-7■■□□□ 13.3
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TRA2AQ13595 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.354e-7■■□□□ 13.3
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TRA2AQ13595 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-32■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-32■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.42□□□□□ -1.222e-32■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 THOC1-217ENST00000584642 536 ntTSL 23.6□□□□□ -1.837e-7■■□□□ 13.3
TRA2AQ13595 RPS25-205ENST00000528547 189 ntTSL 34.07□□□□□ -1.769e-35■■□□□ 13.2
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TRA2AQ13595 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 13.2
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TRA2AQ13595 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-7■■□□□ 13.2
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TRA2AQ13595 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-7■■□□□ 13
TRA2AQ13595 NUMA1-223ENST00000542977 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.75□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 13
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TRA2AQ13595 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.449e-7■■□□□ 13
TRA2AQ13595 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.729e-7■■□□□ 13
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TRA2AQ13595 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-28■■□□□ 13
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TRA2AQ13595 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.13e-28■■□□□ 13
TRA2AQ13595 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.31□□□□□ -1.563e-28■■□□□ 13
TRA2AQ13595 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 519.99■□□□□ 0.793e-10■■□□□ 12.9
TRA2AQ13595 KRI1-207ENST00000537433 671 ntTSL 318.73■□□□□ 0.593e-10■■□□□ 12.9
TRA2AQ13595 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 217.44■□□□□ 0.383e-10■■□□□ 12.9
TRA2AQ13595 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-10■■□□□ 12.9
TRA2AQ13595 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.45□□□□□ -1.73e-10■■□□□ 12.9
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