Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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IFT88Q13099 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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IFT88Q13099 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT88Q13099 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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