Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAX2Q02962 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms