Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNC1Q01954 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms