Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIBQ01892 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIBQ01892 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms