Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F1Q01094 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F1Q01094 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms