Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MTCP1P56278 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MTCP1P56278 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms