Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU3F4P49335 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU3F4P49335 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms