Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACAA2P42765 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACAA2P42765 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms