Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MDH1P40925 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MDH1P40925 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MDH1P40925 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MDH1P40925 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MDH1P40925 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms