Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH1P40692 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH1P40692 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH1P40692 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH1P40692 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH1P40692 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms