Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIPP30301 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIPP30301 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIPP30301 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIPP30301 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIPP30301 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIPP30301 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIPP30301 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIPP30301 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIPP30301 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MIPP30301 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms