Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDSP20132 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDSP20132 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDSP20132 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDSP20132 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDSP20132 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDSP20132 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDSP20132 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDSP20132 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SDSP20132 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDSP20132 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDSP20132 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDSP20132 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDSP20132 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDSP20132 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDSP20132 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SDSP20132 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDSP20132 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms