Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GNAT1P11488 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GNAT1P11488 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms