Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSP90AB1P08238 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms