Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB4AP04350 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB4AP04350 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms