Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP4O95707 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP4O95707 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP4O95707 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP4O95707 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP4O95707 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP4O95707 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP4O95707 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POP4O95707 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms