Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
E2F6O75461 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
E2F6O75461 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
E2F6O75461 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
E2F6O75461 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
E2F6O75461 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
E2F6O75461 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F6O75461 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F6O75461 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.5 ms