Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GLTPD2A6NH11 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms