Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
R4GMQ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
R4GMQ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
R4GMQ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
R4GMQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms