Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHTOPQ9Y3Y2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms