Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN2Q9ULH4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN2Q9ULH4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms