Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCP2D1Q9UJQ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms