Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms