Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXF1Q9UBU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms