Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP36Q9P275 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP36Q9P275 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP36Q9P275 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP36Q9P275 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP36Q9P275 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP36Q9P275 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms