Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANK4Q9NVE7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANK4Q9NVE7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms