Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms