Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGAP3Q9NP61 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFGAP3Q9NP61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms