Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNCQ9H7C4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNCQ9H7C4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms