Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRDQ9H2X0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDQ9H2X0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms