Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms