Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF8Q9BRL6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF8Q9BRL6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms