Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS50Q96JG6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS50Q96JG6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms