Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms