Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UTP4Q969X6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms