Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C6Q969F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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