Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIFAP3Q92845 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms