Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms