Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8N8P6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8N8P6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8N8P6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8N8P6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8N8P6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8N8P6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms