Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSIG10Q8N0Z9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSIG10Q8N0Z9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms