Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOT1Q8IXI2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms