Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01551Q86U37 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01551Q86U37 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms