Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDPD3Q7L5L3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms