Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY3Q7L099 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY3Q7L099 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms