Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC129Q6ZRS4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms